Gra Transformes: War For Cybertron przenosi nas do czasów konfliktu pomiędzy Autobotami, a Deceptikonami, który odbył się przed wydarzeniami na Ziemi, a zatem tymi znanymi z filmów Transformers i Transformers: Revenge of the Fallen. Fabuła Transformes: War For Cybertron stanowi wstęp do wydarzeń znanych z poprzednich gier opowiadających o
Transformersach.
Akcja gry toczy się na rodzimej planecie robotów, Cybertronie, od milionów lat ogarniętej dramatyczną wojną między Autobotami i Deceptikonami. Gracz wciela się w znane z komiksów czy filmów postacie Transformersów, biorąc udział w kolejnych misjach.